BioInformática - Filtro para blast standalone

   
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Filtro para blast standalone

Publicado por Andrea (2 intervenciones) el 17/04/2009 21:39:53
Hola a todos,
Quisiera saber si alquien sabe como puedo realizar alineamientos con BLAST (NCBI) con solo un subset de secuencias de una base de datos.
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Nota: Filtro para blast standalone

Publicado por Andrea (2 intervenciones) el 17/04/2009 21:43:24
No me sirve la opcion -l porque la base de datos no tiene "gi" solo "lcl", quiero filtrar y que solo me busque en las proteinas de un organismo especifico. Dentro del encabezado de la secuencia dice OS="xxxx" quisiera poder decirle solo busqueme en el organismo "xxxx".
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