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Aix es un sistema operativo propietario dedicado a servidor, Linux es libre está destinado tanto para escritorio como para servidores. Yo te aconsejaría Linux, tanto si es para servidor como para escritorio, ten en cuenta que incluso IBM normalmente usa (Red Hat o Suse) en sus servidores. Además en Linux tienes una amplia gama de drivers, y si quieres soporte o certificaciones tanto Red Hat como Novell te pueden funcionar correctamente.
