ODBC - Problemas con ODBC

Hola, tengo dos instancias de base de datos sql server (instancia1, instancia2). En cada una de ellas tengo una base de datos llamada pruebas y he creado dos odbc uno hacia para una de ellas, pruebas1 y pruebas2. Desde una aplicación me conecto a la instancia1 con el odbc pruebas1 y todo bien, pero desde otra aplicación me conecto a la instancia2 con el odbc pruebas2 pero me sale la información de la instancia 1. Los he revisado varias veces y está correcto. No veo a qué se debe.
¿Alguien puede ayudarme?
Saludos.