Hola Jorge:
Podemos utilizar dos aplicaciones de PB que ya existen en la red, para crear un "híbrido" y obtener lo que pides.
1. La primera aplicación, es la llamada systray.zip (26KB), que permanece minimizada en la barra de tareas al lado del reloj. Hallas uno de ellos en:
http://www.stormpages.com/bojanjurca/PBSamples.htm
O busca otros similares (creo que se habló, y ofreció en el foro).
2. La otra aplicación, permite enviar mensajes de una aplicación de PB a otra aplicación de PB. El zip ocupa (48 kb), lo hallas al final de la siguiente página:
http://www.lawebdejm.com/prog/pb/index.html
Nota: Esa PBL me parece interesante; porque en una misma aplicación están "metidas dos aplicaciones"; creo que está así, para realizar la demostración.
3. Ahora, lo que se podría hacer es lo siguiente (no probé; para ser sincero). Esa aplicación que recibe los mensajes, puedes convertirla en un systray (que permanecerá minimizada), y en el momento que reciba el mensaje, puedes hacer que la aplicación destinataria se despliegue en una posición y tamaño determinado. Creo que resultará....