No es cierto. Lo que ocurre es que Windows y su sistema de archivos FAT32 no es el mejor, no es mandatorio que cada cierto tiempo tengas que formatear. Si el sistema de archivos en tu disco está corrmpido mas allá de todo arreglo temo que sí es conveniente que hagas borrón y cuenta nueva, vale decir, debes formatear, sin embargo antes de tomar esta drastica desición te sugiero que pruebes mejores herramientas de reparación tales como el Norton Disk Doctor (honestamente el ScanDisk de Windows a veces rompe más de lo que repara).
Llegado el caso, si tienes que formatear en realidad es un proceso muy simple, basta con crear un disquette de inicio, arrancar con él y emitir el comando del DOS: FORMAT C: /S pero antes debes prepararte con: el CD-ROM de Windows, todos los drivers de tu máquina, hacer copia de respaldo de todos tus archivos personales que no deseas perder ya que una vez iniciada la reinstalación de Windows no hay vuelta atrás.