AJAX - ¿Como evitar que se cirren las carpetas en una lista arbol?

Hola Muy buenas a todos,

He creado una lista en forma de arbol de carpetas , donde se va llenando con datos de unas tablas.
Tambien he creado un panel de control , donde hay 4 campos select que me permiten actualizar el
contenido del arbol mediante previa seleccion de los datos en los campos select

El funcionamiento es el siguiente :

1)Los campos select se llenan mediante consulta directa a la base de datos
2)Mediante ajax recogo los datos que haya seleccionado el usuario en el panel de control y las mando a un archivo para que me processa la peticion.

Todo esto me funciona bien , el problema es que cuando desplego las carpetas , y despues voy al panel de control para
seleccionar otros datos , se me cierran todas las carpetas y yo lo que me interessa es que se me actualize solo la parte del arbol referente a los datos que yo haya seleccionado en el panel de control .

Espero haberme explicado , en cualquier caso si no se entiende , lo explico de nuevo sin ningun problema.

Muchas gracias y Saludos :)

Hola, no me queda muy claro cuando dices que despliegas las carpetas... te refieres a un select? o es una lista de <ul><li> que vas mostrando y escondiendo?
Si nos puedes comentar con mas detalle...