Cuando instalas dropbox en tu ordenador el te crea una carpeta local en documentos del usuario, la cual se sincroniza automaticamente con el web. Se supone que al ser una carpeta local no tengas ningun problema para referenciar archivos desde y hacia ella. Lo importante seria que si las referencias usan ruta absoluta la pongas completa desde la unidad, por ejemplo c:\users\tu nombre\etc etc
Deberia funcionar igual de bien con google drive y autodesk 360, que tambien sincronizan carpetas locales con la nube. Aunque yo pensaria que el servicio de autodesk sea mas eficiente que google y dropbox por ser del propio autodesk.