Eso se debe a que tu programa Clipper es demasiado lento para el procesador del ordenador donde lo estas ejecutando.
Los programas Clipper de 16 bits son demasiado lentos en responder, lo que ocasiona que pierdas ciclos de reloj en procesadores rapidos, como los AMD o mayores de 3 GHZ, eso ocasiona el error que mencionas.
Para solucionarlo necesitaras linkear en tu programa una lib llamada _wait.obj que puedes descargar de www.theoasis.net, esta libreria lo que hace es bajarle la velocidad al procesador para el programa pueda correr, por su puesto, al correr tu programa Clipper y bajarle la velocidad al procesador, vas a experimentar un descenso generalizado de velocidad EN TODAS LAS APLICACIONES que estes ejecutando, la velocidad se recupera cuando termina la ejecucion del programa Clipper.
La otra opcion es pasarlo a Harbour, cosa que te conviene mas porque los programas Clipper MS-DOS de 16 bits NO CORREN EN EL NUEVO WINDOWS VISTA.