Tendrás que publicar tu animación en un servidor (los hay gratis), luego editar en HTML (si tu cliente de correo lo permite) unas líneas de código, más o menos así.
<embed src="http://www.tusitio.com/tuarchivoflash.swf" quality="high" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" type="application/x-shockwave-flash" width="200" height="100"></embed>
Los destinatarios tendrán que poder recibir código HTML embebido para ver la animación.