Si te vas a limitar a transferencia de archivos, no te recomiendo usar NetBIOS cómo en LAN, ya que no funciona bien a través de internet y es relativamente fácil conseguir acceso no permitido :)
Bueno, yo te recomendaría instalar un servidor de FTP gratuito en el ordenador que quieres usar para descargar y subir archivos. Uno sencillo y que yo he utilizado a veces es el
TypSoft FTP Server: http://en.typsoft.com/ .
La configuración es sencilla, tan sólo tienes que instalar, restringir el
acceso anónimo, cambiar el puerto por defecto (recomendable por seguridad,no es que vayan a entrar...pero si cambias el puerto por defecto te libras del 99% de los intentos de ataque), crear un usuario con una clave compleja y establecer un directorio local de acceso.
Con esto instalado en ese ordenador, dispondrías de un servidor FTP para hacer la transferencia de ficheros.
Seguidamente te hará falta un programa para realizar el intercambio de
manera sencilla. Con diferencia el mejor es el FileZilla:
http://filezilla.sourceforge.net/
Debes instalarlo en el ordenador desde el que vas a coger los archivos, y crear una conexión nueva a la dirección de Internet del ordenador con el servidor del FTP y utilizando el nombre y clave de usuario definido en el TypSoft FTP Server..