lo que deberias de hacer es crear una funcion con javascript y dentro de esa funcion poner tu codigo jsp ó llamar algun metodo de jsp. digo es lo mas comodo.
por ejemplo:
function mi_funcion ()
{
<%= codigo jsp %>
<% codigo Jsp %>
}
y desde el boton con llamar la funcion mi_funcion().
La otra manera de llamar a un metodo de jsp, es que desde un boton des la opcion submit y cuando se carge de nuevo la pagina realices alguna accion, esto lo logras a traves de campos ocultos asignandole una cadena descriptiva por ejemplo xAccion.value = "grabar"
Entonces cuando se carga la pgina pones una condicion : if (request.getParameter.xAccion)equals.("grabar") {
Se realiza la accion que tu quiereas.
}
Espero te sirva de algo