El servidor es el mísmo y el index o archivo principal es independiente uno del otro. El que da y asigna las rutas es tu mísmo servidor mediente el IIS (Internet Information Server).
1.- Debes de tener un dominio asignado a un DNS en tu server con una ip específica. 2.- Debes de tener una ip específica para cada dominio ya sea en intranet o en internet.
cuando tengas esa convinación de ips en tu computadora y con propiedades asignadas en DNS e IIS, entonces en propiedades del IIS le indicas en la pestaña de documents cual es tu archivo principal.
Cuando alguien accese a tu dominio, automáticamente entrarán al sitio deseado.