Hola Patricia. Para comparar dos o más números y que la función te devuelva el mayor de todos puedes simplificar tu código con el objeto Math acompañado de la propiedad max de esta manera Math.max(a,b,c.....n)
Funciona de manera parecida a un Array (matriz de elementos), pero sólo actúa con números y lleva implícita la operación buscar el máximo.
Por ejemplo la variable var= Math.max(13,59,33,23,18,98) te devolvería 98
Tu código podría entonces simplificarse del modo siguiente
Obsérvese que aquí he llamado a la variable "mayor" aunque podrías ponerle cualquier nombre, como "pepito_gomez".
Y si quisieras que te seleccionase el número menor de la serie podrías emplear la propiedad "min" de esta forma.
No estoy de acuerdo con el compañero que te responde pues los prompt pueden estar perfectamente dentro de la función, aunque para que dicha función se ponga en funcionamiento al abrir la página deberías acompañar al "body" con el comando "onload" de esta forma:
Un saludo.