Hola Gabriel,
Si la base es local, y desde el cliente 6.5 se libero espacio de la base, puede ser que haya cambiado la version de la base (el ODS), y puede ser que al abrirla desde un R5 te aparezca un mensaje indicando que la versión es invalida.
En la segunda pestaña de las propiedades de la base de datos (donde tambien muestra el tamaño y % usado), figura la version del ODS, que si es 41 esta en version 5, y si es 43 esta en version 6.
En caso que este en version 6, lo que puedes hacer es desde el cliente 6.5, abres la base y generas una nueva replica, poniendole .NS5 a la extension del archivo (esto fuerza a cambiar el ODS de la base a R5), luego, renombras la extension a nsf y ya la vas a poder abrir desde un cliente 5, todo esto, en caso que el problema se deba a un tema de versiones.
Espero que te ayude,
Saludos