MySQL - Añado registros y en un rato se me borran

Muy buenos días,
Tengo una base de datos en versión 5.7.17-log Mysql Server (GLP), donde tengo diferentes tablas.
Una de ellas, es la de usuarios, donde manualmente, a través de mysql o bien a través de web, puedo añadir usuarios, con sus respectivas claves y demás. Además, cada usuario tiene unos permisos para usar unos programas en concreto, vía extranet. El problema viene:
Añado 3 usuarios, independientemente de la forma, vía web, base de datos, mysql....y se me guardan sin problema, y posteriormente les asigno los permisos pertinentes, y se guardan y funcionan durante un tiempo corto, y sin nada más, se borran dichas entradas de registros y en consecuencia, debo registrar de nuevo a los usuarios, permisos, para que en poco tiempo, apenas horas, vuelvan a borrarse....
En cuanto a pruebas realizadas, ha sido la de insertar los usuarios sin permisos, pero tambien se borran.
Paralelamente, añado un permiso de un programa a un usuario registrado anteriormente y el cual no se borra su registro, pero dicho permiso, se borra al poco rato.
Alguien me podría ayudar al respeto? Si necesitan más información, no duden en pedírmela.

Muchas gracias

Hola David, la verdad es que los registros no se borran solos... eso seguro... por lo que puede ser que tengas un procedimiento almacenado, trigger, script, o cualquier cosa que te borra los registros...

Has comprobado si al actualizar algunos permisos estos se reinician? o se mantienen?

Cuando dices al poco tiempo, a cuanto re refieres mas o meno?