RE:problemas con instalacion
Empieza por lo más sencillo, tu problema puede deberse a lo siguiente:
-Que ya tengas una instalación de MYSQL y esté corriendo el servidor de manera automática cuando se inicia el equipo y no lo hayas notado. Deberás desinstalar Mysql.
-MYSQL utiliza por defecto el puerto 3306, Apache Tomcat el 8809, utiliza las opciones por defecto.
Saludos, Cecilia