Seguridad - Proteger programa

Vereis quisiera saber como hacer un disco llave para proteger mis programas del tipo de los que usa Facturplus, así mismo me interesaria saber cuando estos programas se registran con el disco llave en que parte del sistema operativo o en que parte del disco duro dejan la información para saber que el programa ha sido registrado con el disco llave original, me interesaria aplicar un tipo de protección de ese tipo a mis programas, pues aunque no es inviolable pero los usuarios normales de mis programas no lo sabrian desproteger y copiar.
Gracias