Hola:
La factura electrónica puede emitirse desde la propia pagina de AFIP (con clave fiscal), pero solo sirve si son pocas por mes ya que tiene un limite. Ademas que si se esta usando una aplicación propia para emitir facturas implica doble trabajo (registrar las facturas en la aplicación y despues en la pagina de AFIP).
También se pueden emitir facturas electrónicas (obtener el CAE por cada factura a emitir) directamente conectándose a los servidores de AFIP desde una aplicación (sin intervención manual, para evitar el problema del punto anterior). Estos servidores son públicos (AFIP tiene uno de prueba y otro real) y AFIP da ejemplos (en net, java y php) de como acceder y obtener el CAE, aunque pueden ser bastante engorrosos para el que no esta con las nuevas tecnologías (web services, criptograma por clave publica, etc). Es por eso que hay herramientas de terceros (como el OCX que citas y otras interfaces COM) que hacen el trabajo y dejan los datos con sus métodos y propiedades accesibles desde varios lenguajes.
Ademas de obtener el CAE es necesario enviar los datos al cliente, generalmente con un PDF, aunque esto es más fácil y puede hacerse casi en cualquier lenguaje. AFIP no reglamentó esta parte y es suficiente con enviar los datos al cliente (CAE, codigo de barras, detalle de facturas, etc).
Por lo demás, la factura electrónica es como cualquier otro punto de venta (manual, preimpreso, fiscal, etc).
documentacipon técnica de AFIP.
http://wswhomo.afip.gov.ar/fiscaldocs/
herramientas de terceros OCX.
https://sites.google.com/site/facturaelectronicax/
otras herramienta de terceros.
http://www.pyafipws.com.ar/