Visual Basic - Modificar el registro

Quiero que mi programa sea lo primero que cargue windows pero sin hacer un acceso directo en inicio ya que no quiero que el link sea borrado desde DOS. ne dijeron que para eso debo modificar el registro de windows pero no se hacerlo. me pueden ayudar?
lo que quiero es que desde DOS no se pueda borrar ni mi programa ni el modo en que cargue al inicio