Windows 2000 - Active Directory

Muy buenas. Mi consulta es la siguiente , estoy intentando instalar el Active directory en una maquina windows 2000 Server , el plan es que tengo dos dominios separados fisicamente, este hara de DC pero la jerarquia que quiero conseguir seria empresa.com y que de este bosque agragar sucursal1.empresa.com y sucursal2.empresa.com, la verdad que no me aclaro a la hora del orden de crear los dominios, yo antes de instalar el AD instalo el servidor DNS y creo la zona empresa. com, acto seguido instalo el AD con la zona empresa.com lo que despues no consigo agregar los subdomnios, haber si alguien me puede explicar el orden en el que hacer las cosas.
Gracias