Windows 95/98 - particion

alguien sabe donde puedo bajar un software para poder particionar, y que las particiones sean independientes entre si; esto es si en una instalo win98 y en la otra win2000 si falla el win98 y vuelvo a instalarlo no afecte en nada la particion del win2000

Por supuesto, para eso sirven presisamente las particiones.
Un excelente programa es el Partition Magic.
Si vas a tener Win2000 y Win98 en un solo disco te sugiero que instales primero el Win98 en la primera partición y luego Win2000 en la segunda.