Windows - formateo

Hola amigos:
Nunca he formateado un disco duro y ahora me toca hacerlo.Tengo 2 discos duros y el sistema operativo w-me.Mi tema es:quiero formatear el disco esclavo,el mas pequeño,y no se como hacerlo ya que tengo miedo que algo le pase al maestro.Como formateo uno y no el otro?
una vez formateado necesito disco de arranque para que funcione?
necesito instalar w.me otra vez?
con que orden lo formateo y desde donde,msdos?

No aclaras si en el que tú llamas el disco maestro es el que tiene la instalación de WinME hecha, pero asumiré que es asi.
Arranca Windows, entra a Mi PC, click derecho en el D: (que supongo es el disco pequeño) y elije "Dar Formato...", Aceptar y eso es todo, por el C: no te preocupes pues Windows no te permite formatear el disco donde está instalado, es como si quisieras cortar la rama del arbol en la que estas parado :).

Asi lo he hecho y ya esta.Gracias.Pero otra pregunta.Si quiero formatear el maestro (porque algun dia tenga que hacerlo)y en el tengo el sistema operativo que pasos debo de seguir?

Debes crear un disquette de inicio, como te decia en el msg anterior no puedes formatear el disco donde está instalado el sistema operativo que estas ejecutando en ese momento asi que debes crear un disquette de inicio y bootear con él.
El disquette de inicio debe tener tres cosas, el programa FORMAT.EXE, el SYS.EXE y opcionalmente el FDISK.EXE.
Ni bién tengas prompt luego de bootear con el disquette (es decir en la pantalla tienes un A:\) ejecutas FORMAT C: /S y listo.
Luego ejecutas SYS C:, esto transfiere el sistema de arranque, reinicias en modo normal y tendrás el C: booteable pero solo con lo minimo de MS-DOS.

Gracias Diego.
Alberto.