Angel ,
Primero que nada, Bootstrap es un Front-end framework y nada tiene que ver con la configuración o fallos del servidor,
eso es tema aparte.
La versión 3.3.7 es de las mas populares, y ampliamente responsiva, y debería andar perfecto en cualquier navegador,
de hecho la versión 4, resta la compatibilidad con navegadores mas antiguos (IE9- etc),
y de paso sea dicho, el sistema de archivos *.map se ha optimizado/reducido.
Si estas usando bootstrap como parte de un desarrollo de APP's te recomiendo usar la V4,
la cual integra mucho mas herramientas y frameworks de desarrollo disponibles,
así también si estas programando una web, mejor mudarse ahora, y no pasar rabias después.
Partamos por esta etiqueta importantisima en tu html:
Saludos!