PHP - Ejecutar Archivo Bat en PHP

Como puedo Ejecutar un archivo Bat en php y q sintaxis debo poner al archivo bat ya q cuando lo ejecuto me sale un msj de q si kiero copiar un archivo o un directorio

Solo tienes que mandarlo a llamar, por ejemplo:
exec('miarchivo.bat');

Mas información de como ejecutar archivos en el manual:
http://www.php.net/manual/es/ref.exec.php

Ahora bien, para poder ejecutar los archivos .bat tu servidor debe estar en windows, de lo contrario no podras ejecutarlo. Si tu servidor es en windows, y tu archivo esta dentro de las paginas web, y tiene permisos de ejecucución, puedes mandar a llamar directamente el archivo. Por ejemplo:

http://www.misitio.com/miarchivo.bat

Y el resultado del archivo, se mandara al navegador directamente.

Saludos!
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Miguel Angel
Mike79