Python - Problema al importar script

Hola a todos. Trataré de describir lo más claramente posible el problema que tengo. Estoy adaptando un programa de consulta de stock que desarrollé en Windows con Python 2.7 y PyQt4 para que funcione con Ubuntu. El mismo posée una ventana principal con cuatro botones (consultar, ingresar nuevos artículos, modificar artículos y salir). En Windows quedó perfecto: uso el botón Consultar, por ejemplo, y se abre una nueva ventana con sus correspondientes funciones, SIN que se cierre la del menú principal. Si cierro la de consulta, puedo seguir usando la primera, hasta que la cierre. El problema es que en Ubuntu no puedo usar os.startfile, y al usar subprocess.call se abre la segunda ventana, puedo utilizarla perfectamente PERO la primera se bloquea (y hasta toma un tono más oscuro). Qué estoy haciendo mal?