Vaya, no te explicas demasiado bien. Supongamos que utilizas html por encima de php, en ese caso crea un formulario en el que hay un input type=upfile, esto hara que el usuario pueda elegir un fichero a subir.
Bien cuando acepte el envio la variable del input contendra varios valores, dentro de un array, coje los necesarios e introducelos donde quieras. Y ya esta.