hay varias manera de quitar en el msn pero una de ellas tiene manera de volverlo a activar o a instalar si quieres eliminarlo de tu windows sin que vuelva a aparecer este es el metodo que tienes que llevar acabo para eliminarlo del sistema. La forma más sencilla de hacerlo es pulsado en el botón de inicio -> EJECUTAR y escribe lo siguiente que esta abajo sin modificar nada:
RunDll32 advpack.dll,LaunchINFSection %windir%\INF\msmsgs.inf,BLC.Remove
Una vez borrado y reiniciado el equipo no quedará rastro del dichoso Messenger.
saludos.