PDF de programación - Tesis: Jesus Olivares - CONSTRUCCION DE UNA BASE DE DATOS PICTOGRAFICOS CON APLICACION A LA COLECCION DE MICROORGANISMOS CDBB-500 DEL CINVESTA V-lPN

12. ~ +o

CENTRO DE INVESTIGACION Y DE ESTUDIOS

AVANZADOS

DEL INSTITUTO POLITECNICO NACIONAL

Departamento de Ingenieria Electrica

Seccion de Computacion

CONSTRUCCION DE UNA BASE DE DATOS

PICTOGRAFICOS CON APLICACION A LA COLECCION

DE MICROORGANISMOS

CDBB-500 DEL CINVESTA V -lPN

TESIS QUE PRESENT A

JESUS MANUEL OLIVARES CEJA

PARA OBTENER EL GRADO DE MAESTRO EN CIENCIAS EN LA

ESPECIALIDAD DE INGENIERfA ELECTRICA

DIRECTOR DE LA TESIS :

DR . SERGIO ViCTOR CHAPA VERGARA

Mexico, D.F. , septiembre de 1996

Me acerque al hombre sabio y le pregunte
- i,C6mo adquiri6 su sabiduria?
El me contest6
- Preguntando

Hace unos quinientos anos existia en un valle un pais de borregos, en las montanas un pais de
aguilas. Las aguilas cruzaban el valle volando libremente mientras que los borregos se Ia
pasaban pastando . Cerca de ahi estaba el pais de los lobos que se alimentaban con los borregos
y sentian envidia de las aguilas por lo que decidieron atacarlas. Asi un dia los lobos invadieron
el pais de las aguilas y mataron a todas las que pudieron. A las sobrevivientes les decian que no
eran aguilas sino borregos y que no debian volar, que vieran como los borregos andaban
siempre en el suelo, pastando

Actualmente en el pais de las aguilas Ia mayoria andan arrastrandose por el suelo y algunas han
perdido Ia habilidad para volar. Cuentan que afortunadamente, de vez en cuando, pasa un
aguila volando y les grita a sus companeras que recuerden que son aguilas y no borregos, que
pueden volar y son libres

RESUMEN

Se presenta un modelo de base de datos para Ia consulta y registro de informacion acerca de Ia
colecci6n de microorganismos concentrados en CDBB-500 . La idea principal es visualizar las
cepas con sus propiedades y caracteristicas de tal forma que en Ia pantalla se puedan distinguir
colores, formas, tamaiios, etc . adem:is de sus par:imetros. La conceptualizaci6n de Ia base de
datos fue mediante el enfoque relacional y posteriormente se replanteo con base en el
paradigma orientado a objetos. De este ultimo se implantaron clases tipo con metodos de
actualizaci6n y desplegado de datos pictogr:ificos

ABSTRACT

This document presents a database model to query and record information of the CDBB-500
microorganisms culture collection. The m~in idea is to visualize the strains with their properties
and characteristics on such a way that on the screen we can distinguish: colors, shapes, sizes,
etc. besides their parameters. The conceptualization of the database was using the relational
approach, after that it was reestructured based on the object oriented paradigm. Of this last. we
implemented tipical classes with updating methods and pictographical data displaying

INDICE

INTRODUCCION

I ANTECEDENTES

II OBTENCION DEL MODELO CONCEPTUAL Y LOGICO DE LA
BASE DE DATOS

11.1 Recopilacion de datos
11.2 Actividades de una coleccion de microorganismos
11.3 Requerimientos de informacion
11.4 Modelo relacional de Ia base de datos

III VISTAS DEL USUARIO

111.1 Catalogo
111.2 Conservacion
111.3 Morfologia
111.4 fisiologia
111.5 Servicios

IV MODELO ORIENT ADO A OBJETOS DE LA BASE DE DATOS

IV.1 Componentes del sistema de informacion
IV.2 Metodos para actualizacion de datos nominates
IV.3 Metodos para desplegado de datos pictograficos

V BASES DE DATOS ORIENT ADAS A OBJETOS

V.1 Caracteristicas comunes
V.2 Caracteristicas opcionales
V.3 lmplantaciones
V.4 Bases de conocimiento orientadas a objetos

CONCLUSIONES

REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS

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INTRODUCCION

El proposito de este trabajo es obtener el modelo de Ia base de datos para Ia automatizacion
de Ia coleccion de microorganismos CDBB-500, usando una metodologia cuyas etapas mas
importantes son : a) recopilacion de informacion y deteccion de requerimientos, b) analisis de Ia
informacion propuesta de un modelo de Ia base de datos, c) depuracion del modelo, d)
implantacion de clases tipo

El primer modelo de base de datos utilizado fue el relacional por un requerimiento de Ia
Comision Nacional para Ia Conservacion de Ia Biodiversidad (CONABIO), mismo que se
replanteo de acuerdo al paradigma orientado a objetos por Ia ventaja de poder almacenar en Ia
misma base tanto datos nominales como pictograficos

Este trabajo esta dirigido a especialistas del area biologica, a quienes les puede brindar una
idea de las implicaciones en Ia automatizacion de su informacion. Tambien le es uti! a los
estudiosos de computacion e informatica como un caso practico en donde es factible aplicar
muchas de las tecnicas de esas areas. El documento es un elemento de consulta para los
participantes actuales y futuros del proyecto de automatiz~.cion de Ia coleccion CDBB-500 en
cuanto a como se construyo el modelo de Ia base de datos pictograficos

En el capitulo I de este documento se mencionan los antecedentes y las etapas de Ia

metodologia para obtener el modelo de Ia base de datos.

En el capitulo II se desglosan los resultados obtenidos de Ia recopilacion de informacion,

deteccion de requerimientos y Ia vista global de Ia base de datos

El capitulo III detalla cada una de las vistas de Ia base de datos. en Ia cual se indican ademas

el disei'io de las pantallas propuestas para Ia interacci6n con el usuario

El capitulo IV ilustra Ia propuesta del sistema de informacion basado en el paradigma
orientado a objetos. Se complementa con las clases implantadas en Visual Worksm n para
actualizaci6n de datos nominales y despliegue de datos pictograficos

El capitulo V explica Ia mayoria de conceptos encontrados en el enfoque orientado a

objetos de las bases de datos.

En Ia ultima parte se indican las conclusiones y las referencias bibliograficas utilizadas en el

desarrollo de este trabajo

Los datos presentados en este documento referentes al area de aplicaci6n son por cortesia
de Ia colecci6n de microorganismos del Departamento de Biotecnologia y Bioingenieria del
CINVEST A V -lPN ( conocida mundialmente con el acr6mino CDBB-500)

En el documento se mencionan las marcas registradas siguientes

Visual Works1n 1
ACCESSn~tl de Microsoft
GemStone1T' ll de Servio

' de ParcPiace

I ANTECEDENTES

Desde 1990 en el CINVEST A V se iniciaron los trabajos conjuntos entre Ia seccion de
computacion y Ia coleccion de microorganismos CDBB-500, ambos del mismo centro. Para 1992
se logro obtener Ia primera version de una base de datos que proporciono algunos resultados.

En 1994 y como parte de este trabajo de tesis, se retorno el caso, detectando que se carecia de
un modelo apropiado en cuanto a Ia base de datos y se requeria integrar informacion pictogn\fica a
Ia misma. El proposito fue estructurar un modelo que incluyera imagnes mediante Ia aplicacion de
una metodologia consistente de las etapas siguientes ·

a) Recopilacion de datos y deteccion de requerimientos
b) Analisis de datos y disei'io conceptual de Ia base de datos
c) Depuracion del modelo
•
d) Implantacion del modelo de datos

Los datos recabados fueron referentes a conocer que es una coleccion de microorganismos, sus
usuarios, entidades con quienes tiene vinculos, las actividades realiza y sus requerimientos de
informacion tanto actuales como futuros

Con los datos recabados se procedi6 a su analisis para proponer un modelo conceptual de Ia
base de datos, mismo que fue sometido a su revision por varios compai'ieros de Ia seccion de
Computacion del CINVESTAV-IPN y cuyas aportaciones se incluyeron en el mismo.

En una etapa posterior el modelo de Ia base de datos se reestructuro para expresarlo mediante
el paradigma orientado a objetos, aprovechando que un objeto se puede definir como una tabla
que representa una relaci6n.

La implantaci6n de Ia base de datos se realiz6 en dos partes, Ia primera fue en el modelo
relacional y I asegunda consisti6 en definir objetos tipo para actualizaci6n de datos nominates y
despliegue de datos pictograficos

II OBTENCION DEL MODELO CONCEPTUAL Y LOGICO DE LA BASE
DE DATOS

En este capitulo se presentan los datos recopilados del area en que se desarrolla el modelo de Ia
base de datos, las actividades que caracterizan a una colecci6n de microorganismos, sus
requerimientos de informacion y el modelo de Ia vista global de Ia base de datos propuesta

11.1 Recopilacion de datos

Una de las primeras preguntas a responder fue (,que es una colecci6n de microorganismos? Ahora
sabemos que es un centro que preserva, custodia, estudia,
investiga un conjunto de cepas
(microorganismos en un determinado medio de cultivo) de las cuales garantiza su pureza.
viabilidad y confidencialidad Ademils brinda un conjunto de servicios relacionados con su acervo
[9]

Para brindar los servicios y garantizar Ia pureza y viabilidad de las cepas, el personal encargado
de Ia colecci6n estil en un proceso de actualizaci6n continua, recabando datos de distintas fuentes.
por ejemplo: usuarios depositantes, otras colecciones, ceparios, centros de
investigaci6n,
doc:umentos bibliogritficos, asistencia a foros. resultados de estudios e investigaciones que ellos
mismos !levan a cabo, etc. Cada persona dentro de