AJAX - AJAX e IE6

Tengo una aplicación AJAX que funciona de maravilla en Firefox y en Konqueror, pero que no en IE6. Uso la librería Prototype y en principio soporta IE6. La cosa es que creo que el problema más que de AJAX es del método display.

He buscado por ahí y en principio display es soportado...
Alguna otra idea?

Además en el mensaje de error aparece la línea de error de la página, pero esa línea no existe. Me mete todo el Javascript como documento interno de la página aunque sean distintas págians?

Graciasd e entemano