Bases de Datos - ¿Como eliminar registros de la base de datos de acuerdo a las relaciones de tablas?

Hola amigos un saludo, espero se encuentren bien.

Lo que sucede es lo siguiente, estoy desarrollando una aplicación web sencilla para un colegio y estoy trabajando con una base de datos relacional como se observa en la imagen adjunta. En mi aplicación web acceden varios usuarios (Funcionarios,Docentes,Padres,Estudiantes) y cada uno tiene un rol diferente, por ende distintas funcionalidades. Por ejemplo, los estudiantes sólo consultan notas, los docentes actualizan notas, los funcionarios pueden crear y eliminar usuarios en la base de datos; Aquí se plantea mi interrogante, como controlo el tema de la eliminación de usuarios en las tablas teniendo en cuenta las relaciones que poseen las mismas, por ejemplo, si un funcionario desea eliminar el usuario de un padre debería eliminar primero el registro de un estudiante que pertenece a dicho padre, tomando en cuenta la teoría de relación de tablas padres e hijas debido a las llaves primarias y foráneas. Eso es lo que no sé, pues pienso que no sería correcto escribir un mensaje en pantalla diciendo al funcionario, primero debes eliminar el registro del estudiante para eliminar el del padre. Quisiera saber que sería lo más apropiado para estos casos o si debo reformular las relaciones de las tablas. Les adjunto también el código de la aplicación que está en PHP y el backup de la base de datos. Disculpen por escribir tanto y les agradezco mucho.

• ProyectoSoged.rar(771,7 KB)

Pues existe el borrado en cascada cuando diseñas tu base de datos, aunque no todas lo soportan.... a mi no me gusta eso... Prefiero iniciar una transaccion y empezar a borrar los registros de las tablas relacionadas, hasta llegar a la tabla padre y terminar la transaccion, si no hubo error se hace un commit y si existio alguna falla, se descartan todos los cambios con un rollback