C/Visual C - Disco de arranque no windows

¿Quien sabe como hacer que un disco duro o un disquete sean reconocidos como disco de arranque?, pero no con windows, es por ejemplo que hagas un mini so, o un programa que hagas, y al instalarlo donde sea se reconozca como disco de arranque, (Al igual que cuando se instala Windows o cualquer otro sist. opreativo) eso me ayudaria a arrancar un programita que toy aciendo. espero respuesta... hasta luego y gracias