C/Visual C - abrir y escribir en cualquier directorio

Hola, tengo un pequeño problemilla con un programa y no se como solucionarlo. Utilizo visual stuido 6, c++ y WinXP. Mi problema es que al darle al programa (por teclado) un archivo origen y un destino que no estén situados en su mismo directorio, peta diciendome: No such file or directory. No entiendo muy bien sta salida xq si es fallo del programa, ¿xq me salta ese error de MS-DOS?
Muchas gasias.

Un saludo.

No se mucho de Visual C++, pero el emnsaje de error es por general un error producido por que no puede encontrar un Path(de un directorio o archivo)y como vos estas pasando un path , y mas por teclado, es posible queescribas mal los path.

Saludos

Tal vez, no se. Los path los he probao a escribir entre comillas y sin ellas, y nombrandolos desde la unidad lógica y con la " \ " (barrita de windows). No se lo mismo es por eso, pero ya no se con qué probar.