C/Visual C - Advanced: Eliminar Procesos por Nombre...

Quisiera saber que funcion es la que me da el handle de un proceso del cual solo conozco el nombre. Digamos por ejemplo que quisiera eliminar el proceso del SysTray o cualquier otro proceso que aparece en el Administrador de Tareas y que no tiene una ventana asociada.
El caso en concreto es un programa que estoy haciendo que lanza un ftp y para ello uso el ftp del Dos. Al ser una instruccion de MS-Dos se lanza una ventana windows de emulacion de MS-Dos la cual obligo a que no aparezca con un SW_HIDE, pero al terminar el proceso es imposible cerrar esta ventana o mejor dicho, si consigo cerrar la ventana con su handle pero queda un residuo de algun threat o algo que se llama WinOldApp o algo asi que no se como eliminar.

Gracias.