HTML - Por que al declarar el doctype de html5 mi css cambia

Hola tengo un atributo css


la cosa es que al definir el doctype


automáticamente me deja de reconocer los estilos que aplique en el header (de tamaño en porcentaje) el bg color se aplica pero no entiendo por que el tamaño se pierde al aplicar el doctype :c

(si hay algún error de syntaxis omitanlo ya que en mi documento tengo todo bien escrito acá lo escribí a mano)

Hola Cristofer, el header en que marco esta comprendido?
Es decir, si el continente no tiene altura, el % no es del todo valido, ya que no es el % sobre la pagina, sino sobre el continente del header.

No se si me he sabido explicar... de todos modos, utilizar un % para la altura, no es una recomendación muy buena...