Yo opino que el mejor IDE es el que mejor se adapta a tus necesidades y más cómodo te permite trabajar, y como eso es algo muy subjetivo, no podría decirte cuál es mejor que otro.
Lo que sí te puedo decir es que he trabajado y trabajo con Netbeans y con Eclipse. Ambos muy buenos.
Si estás empezando, entre los dos te aconsejaría Netbeans, es más sencillo y te permite diseñar Frames desde un editor gráfico sin tener que añadirle nada, mientras que Eclipse necesita de un plugin para ello.
De hecho, yo uso Eclipse para crear aplicaciones web complejas, pero para aplicaciones de escritorio uso Netbeans por su facilidad a la hora de diseñar ese tipo de pantallas.
Espero que mi consejo al menos te sirva para conocer ambas opciones y decantarte por alguna de ellas. Esto no quiere decir que no haya más, pero sin duda estos dos son de los mejores.
Un saludo!
