Java - Cerrar programas abiertos,desde java???

Saludos programadores,pues resulta que estoy desarrollando un sistema en el que necesito cerrar todas las ventanas abiertas. entonces no se si habra alguna manera para hacerlo desde codigo java,de antemano gracias!!!

Usa esto:
marco.setDefaultCloseOperation(JFrame.EXIT_ON_CLOSE);

dinde marco es un JFrame, esto significa k cierras los marcos de la interfaz grafica y cierra el programa, si por el contrario solo quieres cerrar una ventana:
marco.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);

Espero k te sirva, saludos