Java - problema intentado poner un terminal en un jtextarea

Buenas noches. Mi problema es el siguiente:
Necesito poner un terminal en un jtextarea, para utilizarlo en un programa.
Consigo lanzar ordenes con Runtime.getRuntime().exec(cadena); y escribir la salida de la orden en el jtextarea, con un inputstream.
El problema es que necesito introducir datos después de lanzar la orden.
No escribe el texto hasta que termina de ejecutar la orden, y tampoco me deja introducir datos. Se queda colgado.
Agradecería cualquier ayuda, ya que estoy un poco atascado.
Gracias de antemano.

He encontrado un terminal en Google que creo que me serviría. El problema es q utiliza una clase llamada protocolo. Por ejemplo protocolo.callback
Me da error al compilar de class not found. Alguien sabe cómo compilar con esa clase?
Gracias