Java - Ayuda con arreglos

public class Arreglos {

    public static void main(String[] args) {

        int[] arregloA = {2, 4, 6, 9, 12};

        int[] arregloB = {1, 2, 6, 7, 10};

        int[] arregloC=new int [5];

        int aux = 0, aux1= 0;

        int n=0;

        for (int i = 0; i < arregloA.length; i++) {

            arregloA[i]=aux;

            for (int j = 0; j <arregloB.length; j++) {

                arregloB[i]=aux1;

            }

            if(aux==aux1){

                System.out.println("");

            }

        }

        }

    }

usando n=0; ya tienes casi todo hecho

 for (int i = 0; i < arregloA.length; i++) {

           for (int j = 0; j <arregloB.length; j++) {

              if( arregloA[i] == arregloB[J] ){

                    arregloC[n]= arregloA[i];

                    n++;

                    break;

              }

            }

 }

// Ya luego si quieres recorres el tercer arreglo para ver lo que ha impreso

for (int i = 0; i < arregloC.length; i++) {

    System.out.println("Posición "+i+" Valor: "+ arregloC[i]);

}