Java - Problemas graficos

Hola foro
El problema es el siguiente. Poseo una ventana principal que llama a otra ventana (modal) la cual recoje un dato y se lo pasa a la principal. En este punto se produce una llmada a unmetodo con mucha carga de CPU. Esto provoca que el dialogo se quede como pillado, en vez de desaparecer. Alguien sabe como solucionarlo? Gracias

crea un Thread:

new Thread ()
{
public void run ()
{
//tu código
}
}.start ()

o usa el método javax.swing.SwingUtilities.invokeLater ()