Java - Problemas Runtime y Process

Tengo un problema con la clase Runtime y Process. El caso es que con el método exec de la clase Runtime, lanzo un proceso. Este método devuelve un objeto de tipo Process, se supone que con este objeto tengo el control del proceso, pero no es así. De hecho en la Api del jdk te dicen y cito textualmente: "The Runtime.exec methods may not work well for special processes on certain native platforms, such as native windowing etc........". El caso es que yo llamo al Windows Media Video mediante la clase Runtime, ésto me devuelve un objeto Process, cuando intento hacer un destroy sobre este objeto devuelto no obtengo el efecto deseado. Mi pregunta es si tenéis alguna manera alternativa de hacer ésto, es decir, llamar desde java a un windows media video y luego cerrarlo cuando me de la gana.