Java - Autenticacion servicios web

Tengo un servicio web que se encarga de consultar una serie de servicios web https con certificado de seguridad. Los servicios web se llaman a través de hilos para hacer consultas en paralelo.
¿Cuál es la forma correcta de implementar la seguridad en mi modelo de aplicación?

Si accedo a sólo un servicio web no tengo problema, pero al acceder al segundo me envía la siguiente traza de error:

AxisFault
faultCode: {http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/}Server.userException
faultSubcode:
faultString: javax.net.ssl.SSLHandshakeException: sun.security.validator.ValidatorException: No trusted certificate found
faultActor:
faultNode:
faultDetail:
{http://xml.apache.org/axis/}stackTrace: javax.net.ssl.SSLHandshakeException: sun.security.validator.ValidatorException: No trusted certificate found
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.BaseSSLSocketImpl.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SSLSocketImpl.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SSLSocketImpl.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SunJSSE_az.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SunJSSE_az.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SunJSSE_ax.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SSLSocketImpl.a(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SSLSocketImpl.j(DashoA12275)
at com.sun.net.ssl.internal.ssl.SSLSocketImpl.startHandshake(DashoA12275)
at org.apache.axis.components.net.JSSESocketFactory.create(JSSESocketFactory.java:224)
at org.apache.axis.transport.http.HTTPSender.getSocket(HTTPSender.java:157)
at org.apache.axis.transport.http.HTTPSender.invoke(HTTPSender.java:114)
at org.apache.axis.strategies.InvocationStrategy.visit(InvocationStrategy.java:71)
at org.apache.axis.SimpleChain.doVisiting(SimpleChain.java:150)
at org.apache.axis.SimpleChain.invoke(SimpleChain.java:120)
at org.apache.axis.client.AxisClient.invoke(AxisClient.java:180)
at org.apache.axis.client.Call.invokeEngine(Call.java:2564)
at org.apache.axis.client.Call.invoke(Call.java:2553)
at org.apache.axis.client.Call.invoke(Call.java:2248)
at org.apache.axis.client.Call.invoke(Call.java:2171)
at org.apache.axis.client.Call.invoke(Call.java:1691)

A continuación, indico el código Java que utilizo para añadir los certificados de seguridad.

Servicio Web1:
System.setProperty("java.protocol.handler.pkgs",
"com.sun.net.ssl.internal.www.protocol");
Security.addProvider(new com.sun.net.ssl.internal.ssl.Provider());
System.setProperty("javax.net.ssl.keyStore", "prueba.jks");
System.setProperty("javax.net.ssl.keyStorePassword","mi_password");
System.setProperty("javax.net.ssl.trustStore","prueba.jks");
System.setProperty("javax.net.ssl.trustStorePassword","mi_password");

Servicio Web2:

System.setProperty("java.protocol.handler.pkgs",
"com.sun.net.ssl.internal.www.protocol");
Security.addProvider(new com.sun.net.ssl.internal.ssl.Provider());
System.setProperty("javax.net.ssl.keyStore", "mio.keystore");
System.setProperty("javax.net.ssl.keyStorePassword","pass");
System.setProperty("javax.net.ssl.trustStore","mio.trustore");
System.setProperty("javax.net.ssl.trustStorePassword","pass");

Gracias, por adelantado.