Java - copiar nombre de archivo leido

hola:

Tengo el siguiente problema:

tengo una serie de archivos que son leidos por un fileinputStream, todos a la ves, y les realizo cierto proceso, campos especificos, y copio la salida a otro archivo despues de hacer el proceso a todos los archivos, el problema es que toda la informacion de todos los archivos leidos queda en un solo archivo de salida y no se como reconocer que informacion pertenece a que archivo, necesito precisamnete el nombre del archivo leido. si alguien conoce algun metodo. gracias