Java - Applet y metodos nativos

Buenas tardes, les escribo porque tengo un problema con un applet que se comunica con una clase java que contiene métodos nativos. El problema es el siguiente: en el applet creo un objeto de la clase que tiene los metodos nativos y a través de este objeto envío y recibo parámetros a una dll. El applet ya está firmado así que no tengo problemas de permisos. Pero cuando envío parámetros para abrir el puerto serial sucede una excepción, y según creo yo, esta excepción se da en la dll, con lo cual no sería problema de java. Pero probé con una aplicación java que usa la misma dll y no el funcionamiento es correcto. Para resumir, a través de la aplicación sí puedo abrir el puerto, pero cuando lo intento a través del applet sucede una excepción en la dll. Si alguien tuviera una idea o sugerencia se lo agradecé mucho.