Linux - ayuda con mysql

hola, quisiera saber como hago para cambiar de tipos de tablas osea quiero cambiarme a una de tipo de transaciones seguras como InnoDB ò BDB, para asi poder controlar lo de las tranciones con commit o rollback.
quisiera saber si esto trae algun problema en el funcionamiento de la base de datos.
y tambien si por ejemplo tengo varias clausulas y todavia no he dado commit al darle rollback me deshace todo?
gracias por la atencion prestada.