Linux - Dos discos win2000 y redhat 7.3

Tengo dos unidades de disco una de 40Gb con windows(NTFS) y otra con red hat linux 7.3(8.0Gb), cada una es independiente de la otra, es decir, cuando linux funciona desconecto el disco que contiene windows y viceversa, lo que quiero es saber si puedo hacer que Linux controle los dos discos para que eliga el SO con el que deseo iniciar, supongo que tengo que dejar el disco que contiene Linux como maestro y el de windows como esclavo, puesto que habia puesto el de linux como esclavo y no arrancaba Linux, como debo de modificar LILO para que reconzca el disco con Windows, y que debo de hacer en linux(KDE) para que agrege el disco de windows.
de antemano gracias a quien conteste este pequeño caso.

dos cosas:
- para poner en marcha el linux y el w2k a la vez utiliza el grub como modo de arranque.
- deberas recompilar el nucleo del linux para que reconozca particiones ntfs.