Linux - Alguien me orienta...

Tengo un servidor novell. el cual quiero eliminar totalmente. a el se conectan clientes de windows. para ejecutar ciertas aplicaciones de windows. quiero saber si monto un servidor linux las aplicaciones se seguiran ejecutando normalmente desde las estaciones linux. me imagino que todo se hará a través de samba, peroalguien lo ha hecho demen pistas por favor o diganme a donde leer toda esta carreta gracias

que es exactamente lo que hace el servidor novell y lo que quieres hacer en las estaciones