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Me imagino que te refieres a las distribuciones de Linux (Debian, Gentoo, SuSE, Fedora, etc).
Pues esa es la pregunta del millón de dólares como quien dice, no hay una respuesta definitiva para eso, la mejor distribucíón es la que mejor se adecue a tus necesidades, yo particularmente te recomiendo Debian GNU/Linux