Linux - virus en una página en un servidor linux

Hola Soy Patricia:
Y tengo un problema, tengo una página grande con bases de datos, muchas imagenes y que se va actualizando con un "panel de control". Hace unos dias cuando uno la visita aparece un cartel del distintos antivirus que el hecho de utilizarla podria contagiar varios virus un troyano,etc.
como puedo hacer para eleminar estos virus?
Si a alguien se le ocurre algo le estaria muy agradecida si me da alguna pista.
Saludos a todos

creo que la pagina de AVAST hay un antivirus para linux

Muchas gracias lo voy a tener en cuenta, en realidad lo solucione, bajando todos casi todos los archivos y scaneando con el Bitdefender. No encontre el virus que buscaba pero al subirlo ya no paso mas ni en mi ordenador ni en otros que fui probando. Asi que de alguna manera lo solucione.
Saludos