PHP - editar un fichero dentro de un archivo .phar

Hola, soy nuevo trabajando conarchivos .phar, pero necesito solucionar un error:

PHP Notice: Undefined offset: 4 in phar:///opt/www/siloff/var/nifoff.phar/src/Lks/Util/Dos.php on line 7

Algun master que me de una mano ??

De antemano agradezco su ayuda

Hola, puedes usar el metodo extractTo de la clase Phar que provee PHP para el manejo de archivos phar

https://secure.php.net/manual/es/phar.extractto.php

muchas Gracias por tu respuesta, pude extraer los ficheros, pero mi situación es que dentro de un archivo.phar debo modificar una sentencia de un fichero , es decir como vuelves a emvolver los ficheros en el .phar
Gracias por tu valiosa ayuda