Seguridad - Encriptación On-Line de datos

Encriptación de datos durante una transacción On-Line, procesos utilizados para la realización de los mismos,requisitos necesarios, ventajas que ofrece y bibliografías recomendas.

El tema que indicas es muy amplio y complejo. La criptología no sólo se emplea para encriptar datos en transacciones, si no para autentificar a los que realizan la transacción, evitar interferencias, asegurar la integridad de los datos transmitidos -- y además para asegurar su confidencialidad. Así entendido, el tema abarca toda la criptología, cualquier libro introductorio sobre el tema es bueno. Te mandaré por mail mi referencia online favorita.
Para implementar buena criptología -en el sentido comercial- con toda facilidad lo mejor que conozco es Java. Revisa su API y encontrarás de todo: algoritmos de clave pública (RSA, Diffie-Hellman), clave privada (DES y derivados, creo recordar), integridad (MD5 y SHA-1), firmas digitales (DSA, DSS). No respondo de la robustez del API de Java porque no es de código libre, pero los muchachos de SUN acostumbran a ser gente competente.

Vaya, la referencia que más me gusta -a nivel introductorio- es "Handbook of applied cryptography" de Alfred Menezes, Paul Oorschot y Scott Vanstone. Lo conseguí en www.crcpress.com en formato pdf, pero al volver a visitar la página no he encontrado opción de bajárselo (sin aflojar 85 pavos). El libro me gustó bastante, y está realmente al día, dando una descripción completa de muchos algoritmos célebres -así como los ataques hasta la fecha-. También incluye una introducción (breve pero suficiente) al trasfondo matemático que todo el que se involucre en criptología debería saber. El libro incluye muchas referencias a otros libros y artículos interesantes, más concretos y avanzados.
Ignoro si lo podrás encontrar en algún otro lugar por la gorra.

Puedes bajarte todos los capítulos del libro en http://go5.163.com/~charleyli/tech/security/hac/about/ incluyendo ejemplos de código fuente en C.